Yıl 1688, yer Londra...
Gece yarısı laboratuvarında çalışmakta olan Isaac Newton, gizemli bir hırsızın saldırısına uğrar ve içinde simyacılıkla ilgili notların bulunduğu defteriyle bazı deney aletleri çalınır. Fakat bu pek de sıradan bir hırsızlık vakası gibi görünmez, çünkü simyacılıkla uğraşmak son derece tehlikeli bir iştir; hatta dönemin İngiltere'sinde ağır bir suçtur! O hâlde böyle bir çılgınlığa kim, neden kalkışmış olabilir?
Newton'dan özel dersler alan öğrencisi George ve onun arkadaşı Molly, zor durumdaki Newton'a yardım etmeye karar verirler. îki zeki genç, usta birer dedektif gibi rastladıkları ipuçlarının izini sürmek üzere Londra'nın dar sokaklarını arşınlamaya başlarlar. Hırsızı bir an önce bulmalıdırlar; çünkü sadece bir bilim insanı olarak Newton'un itibarı değil, aynı zamanda bir insanın hayatı da tehlikededir!