Evren kuşatma altında. Her elli bin yılda bir, akıllı makinelerden meydana gelen bir ırk galaksimizi işgal ediyor ve tüm organik canlıları hasat ediyor. Bunlar Reaperlar. Bu durumun farkında olan iki kişi, Amiral David Anderson ve Kahlee Sanders, bu döngüye engel olmanın bir yolunu bulmaya çabalıyorlar. Reaper tehdidinin gerçek olduğuna dair ürkütücü kanıtlar da elde ettiler. Ancak hedeflerine ulaşmaya çalışırken, gizli bir organizasyon olan Cerberus ve bu organizasyonun gizemli lideri Asılsız Adam'ın entr